«Проект реализуется с использованием гранта Президента
Российской Федерации, предоставленного Фондом президентских грантов»
00000000О ПРОЕКТЕ
Развитие наук о человеке (биология, медицина) в XXI веке связано с анализом
большого объема данных. Это не традиционный анализ медицинский данных, когда
собираются истории болезни или производится анализ клинических испытаний, но что-то
близкое.
Сейчас врачи используют геном человека как еще один образцов для анализа,
который может дать довольно много всякой информации. Это называется
«персонализированной медициной».
Направление в науках о человеке, которое направлено на сбор и анализ больших
данных, называют биоинформатикой. Предметом биоинформатики являются молекулярные
процессы, исследования которых проводятся не in vitro, а in silico, т.е. не в пробирке, а при
помощи компьютеров.
Технологии биоинформатики необходимы в биохимии, биофизике, экологии,
фармакологии, сельском хозяйстве, генетике и других сферах. За почти 10 лет объем рынка
биоинформатики вырос в 5,5 раз (около 500 млн.долл ежегодно). Биоинформатика обладает
огромным потенциалом. На международном рынке труда есть дефицит биоинформатиков, в
них заинтересованы как фармакологические, так и IT-компании.
По словам директора Института проблем передачи информации РАН Михаила
Гельфанд, биоинформатика – это область, в которой действительно есть шанс сделать что-то
безумно интересное. Просто потому что прогресс в науке — и технологический, и в понимании
— происходит с невероятной скоростью… Мы очень сильно недорабатываем с данными,
которые есть, не вынимаем оттуда все, что можно было бы использовать». И связано это
прежде всего с тем, что много данных получить уже не проблема, а специалистов, способных
с этими данными работать крайне мало.
С целью формирования у молодых исследователей, ученых, студентов и школьников
дополнительных компетенций в области анализа больших био-данных создан проект Летняя
школа Биоинформатики для школьников, студентов, молодых ученых.
Проект инициирован сообществом молодых ученых Балтийского федерального
университета им.И.Канта и поддержан Ассоциацией учителей и преподавателей биологии
региона.
В основу обучения в научной школе лягут прикладные исследования под руководством
специалистов в области биоинформатики, вычислительной биотехнологии, возможность
пробовать себя в самых передовых технологических областях, экспериментировать, а также
получить углубленные знания и опыт работы над реальными задачами.
Школа будет проведена на русском языке.
В течение 5 учебных дней в научной школе участники будут осваивать технологии
биоинформатики и вычислительной биологии, научатся применять языки программирования
для решения исследовательских задач, строить пайплайны, визуализировать результаты,
обрабатывать данные NGS и прочим навыкам, смогут стать частью профессионального
сообщества. Участие в школе бесплатное. Реализация проекта совместно с Балтийским
федеральным университетом им.И.Канта и Ассоциацией учителей и преподавателей
биологии региона позволит использовать современное оборудование исследовательских
лабораторий, привлечь в качестве лекторов и наставников школы ведущих специалистов в
области биоинформатики и вычислительной биологии и реализовать проект с максимальной
эффективностью.
большого объема данных. Это не традиционный анализ медицинский данных, когда
собираются истории болезни или производится анализ клинических испытаний, но что-то
близкое.
Сейчас врачи используют геном человека как еще один образцов для анализа,
который может дать довольно много всякой информации. Это называется
«персонализированной медициной».
Направление в науках о человеке, которое направлено на сбор и анализ больших
данных, называют биоинформатикой. Предметом биоинформатики являются молекулярные
процессы, исследования которых проводятся не in vitro, а in silico, т.е. не в пробирке, а при
помощи компьютеров.
Технологии биоинформатики необходимы в биохимии, биофизике, экологии,
фармакологии, сельском хозяйстве, генетике и других сферах. За почти 10 лет объем рынка
биоинформатики вырос в 5,5 раз (около 500 млн.долл ежегодно). Биоинформатика обладает
огромным потенциалом. На международном рынке труда есть дефицит биоинформатиков, в
них заинтересованы как фармакологические, так и IT-компании.
По словам директора Института проблем передачи информации РАН Михаила
Гельфанд, биоинформатика – это область, в которой действительно есть шанс сделать что-то
безумно интересное. Просто потому что прогресс в науке — и технологический, и в понимании
— происходит с невероятной скоростью… Мы очень сильно недорабатываем с данными,
которые есть, не вынимаем оттуда все, что можно было бы использовать». И связано это
прежде всего с тем, что много данных получить уже не проблема, а специалистов, способных
с этими данными работать крайне мало.
С целью формирования у молодых исследователей, ученых, студентов и школьников
дополнительных компетенций в области анализа больших био-данных создан проект Летняя
школа Биоинформатики для школьников, студентов, молодых ученых.
Проект инициирован сообществом молодых ученых Балтийского федерального
университета им.И.Канта и поддержан Ассоциацией учителей и преподавателей биологии
региона.
В основу обучения в научной школе лягут прикладные исследования под руководством
специалистов в области биоинформатики, вычислительной биотехнологии, возможность
пробовать себя в самых передовых технологических областях, экспериментировать, а также
получить углубленные знания и опыт работы над реальными задачами.
Школа будет проведена на русском языке.
В течение 5 учебных дней в научной школе участники будут осваивать технологии
биоинформатики и вычислительной биологии, научатся применять языки программирования
для решения исследовательских задач, строить пайплайны, визуализировать результаты,
обрабатывать данные NGS и прочим навыкам, смогут стать частью профессионального
сообщества. Участие в школе бесплатное. Реализация проекта совместно с Балтийским
федеральным университетом им.И.Канта и Ассоциацией учителей и преподавателей
биологии региона позволит использовать современное оборудование исследовательских
лабораторий, привлечь в качестве лекторов и наставников школы ведущих специалистов в
области биоинформатики и вычислительной биологии и реализовать проект с максимальной
эффективностью.
00000НОВОСТИ
28.10.2022 Карбоновый полигон Росянка: экскурсия школьников Школы будущего в рамках проекта https://strana39.ru/news/obuchenie/101233/dlya- shkolnikov-kaliningrada-ustroili-ekskursiyu-na-karbonovyy- poligon-rosyanka.html |
000000019.10.2022
СМИ о том, как прошла открытая лекция
Биоинформатика, климат и экология: проблемы
человечества - миф или реальность?
https://strana39.ru/news/obuchenie/101194/lektsiya-o-vzaimosvyazi-bioinformatiki-i-ekologii-kasalas-problem-chelovechestva.html
Биоинформатика, климат и экология: проблемы
человечества - миф или реальность?
https://strana39.ru/news/obuchenie/101194/lektsiya-o-vzaimosvyazi-bioinformatiki-i-ekologii-kasalas-problem-chelovechestva.html
14.10.2022 Открытая лекция Биоинформатика, климат и экология: проблемы человечества - миф или реальность? 19 октября 2022 г. 17.00 ул.Университетская, 2-326 Коровы выделяют парниковые газы Майнинговые фермы дают столько же выбросов СO2 как целая Австрия Потоковые просмотры YouTube и Netflix тратят энергии больше, чем вся Испания Приглашаем всех желающих на открытую лекцию научного сотрудника Высшей школы живых систем БФУ им.И.Канта, к.т.н. Куликовой Юлии Владимировны. |
10.10.2022 Поздравляем участников проекта с успешной защитой своих идей! 10 сентября 2022 участники проекта "Летняя школа Биоинформатики для школьников, студентов, молодых ученых успешно защитили свои проекты в рамках хакатона! Хакатон по биоинформатике - это марафон программирования, когда на одной площадке собираются команды и применяют имеющиеся навыки и знания для создания программного решения проблем из различных области биоинформатики. Первое место - Поиск гентических маркеров устойчивости бактерий к антибиотикам Скуднов Алексей Тимофеев Александр Курило Илья Зайцева Вероника Второе место - Оценка данных секвенирования вируса на принадлежность к квазивидам опасного штамма Болотов Эрнест Градов Антон Канаева Ангелина Кирьяк Анастасия Козырева Анфиса Мацукевич Алексей Смирнова Дарья Третье место - NGS-анализ данных секвенирования вирусов Гончар Анастасия Ширина Светлана Пороц Мелина |
000000007.10.2022
У нас каждый день проходят стримы по
биоинформатике! Присоединяйтесь!
https://discord.gg/C5g9V69n, канал Лекторий
биоинформатике! Присоединяйтесь!
https://discord.gg/C5g9V69n, канал Лекторий
000000006.10.2022
Узнать расписание занятий и программу Школы
можно по ссылкам на сайте
можно по ссылкам на сайте
000000005.10.2022
Первый день Школы! Полет нормальный!
000000004.10.2022
Все, кто интересуется биоинформатикой, могут задать
вопросы нашим наставникам!
Станислав Сухих, д.т.н.
Ирина Доминова.
Записаться на консультацию можно по телефону
89236167956
вопросы нашим наставникам!
Станислав Сухих, д.т.н.
Ирина Доминова.
Записаться на консультацию можно по телефону
89236167956
03.10.2022 Открытие Школы биоинформатики – состоялось! Поздравляем всех участников! Желаем плодотворной работы! |
0000000001.10.2022
00000000030.09.2022
00000000025.09.2022
Уважаемые участники! Прием заявок закрыт!
Познакомиться с расписанием школы участники могут
по ссылке
расписание
Познакомиться с расписанием школы участники могут
по ссылке
расписание
00000000015.09.2022
01.09.2022 С днем знаний! Успехов в учебе и отличного настроения! |
00000000022.08.2022
00000000015.08.2022
00000000002.08.2022
Много интересного о профессиях будущего написано
в Атласе профессий, разработанном СКОЛКОВО И АСИ
https://atlas100.ru/catalog/
в Атласе профессий, разработанном СКОЛКОВО И АСИ
https://atlas100.ru/catalog/
000000000018.07.2022
Чем занимаются биоинформтики? Классный кейс
можно найти в видео по ссылке
https://yandex.ru/video/preview/8064079716918471628
можно найти в видео по ссылке
https://yandex.ru/video/preview/8064079716918471628
000000000001.07.2022
Ура! Мы приступили к подготовке Школы!
000000МЕДИА
РАСПИСАНИЕ
Дата
03.10.2022
04.10.2022
05.10.2022
06.10.2022
07.10.2022
08.10.2022
09.10.2022
10.10.2022
03.10.2022
04.10.2022
05.10.2022
06.10.2022
07.10.2022
08.10.2022
09.10.2022
10.10.2022
Тема
Открытие хакатона. Лекция «История развития
молекулярно-генетических методов анализа.
Разнообразие геномов и их структура»
Биоинформатика как новая наука
Установка и выдача заданий на хакатон
Консультации
Подготовка данных к анализу
Основные ферменты генетической инженерии
Основные статистические показатели
Вычисление описательных характеристик в R
Построение и интерпретация графиков в R
Меры различий несвязанных выборок
Маппирование на референсы
Методы выделения нуклеиновых кислот
Сравнение несвязанных выборок в R
Однофакторный и многофакторный дисперсионный анализ
Дисперсионный анализ в R
Работа команд над проектами
Поиск вариаций
Блоттинг
Меры различий связанных выборок
Сравнение связанных выборок в R
Корреляция и линейная регрессия
Корреляция и линейная регрессия в R
Работа команд над проектами
Анализ найденных вариантов
Секвенирование нуклеиновых кислот
Логистическая регрессия
Дискриминантный анализ
Работа команд над проектами
Визуализация и интерпретация
Молекулярная филогенетика
подготовка к презентации проектов
Защита проектов
Открытие хакатона. Лекция «История развития
молекулярно-генетических методов анализа.
Разнообразие геномов и их структура»
Биоинформатика как новая наука
Установка и выдача заданий на хакатон
Консультации
Подготовка данных к анализу
Основные ферменты генетической инженерии
Основные статистические показатели
Вычисление описательных характеристик в R
Построение и интерпретация графиков в R
Меры различий несвязанных выборок
Маппирование на референсы
Методы выделения нуклеиновых кислот
Сравнение несвязанных выборок в R
Однофакторный и многофакторный дисперсионный анализ
Дисперсионный анализ в R
Работа команд над проектами
Поиск вариаций
Блоттинг
Меры различий связанных выборок
Сравнение связанных выборок в R
Корреляция и линейная регрессия
Корреляция и линейная регрессия в R
Работа команд над проектами
Анализ найденных вариантов
Секвенирование нуклеиновых кислот
Логистическая регрессия
Дискриминантный анализ
Работа команд над проектами
Визуализация и интерпретация
Молекулярная филогенетика
подготовка к презентации проектов
Защита проектов
09000Наставник
00000Доминова Ирина
00000Сухих Станислав
00000Виктор Шаманский, Валерия
00000Лобанова
00000Доминова Ирина, Сухих
00000Станислав
00000Доминова Ирина
00000Сухих Станислав
00000Доминова Ирина, Сухих
00000Станислав, Виктор Шаманский,
00000Валерия Лобанова
00000Доминова Ирина
00000Сухих Станислав
00000Доминова Ирина, Сухих
00000Стванисла
00000Доминова Ирина, Сухих
00000Станислав, Виктор Шаманский,
00000Валерия Лобанова
00000Доминова Ирина
00000Сухих Станислав
00000Доминова Ирина, Сухих
00000Станислав
00000Доминова Ирина, Сухих
00000Станислав, Виктор Шаманский,
00000Валерия Лобанова
00000Доминова Ирина
00000Сухих Станислав
00000Доминова Ирина, Сухих
00000Станислав
00000Доминова Ирина, Сухих
00000Станислав, Виктор Шаманский,
00000Валерия Лобанова
00000Доминова Ирина
00000Сухих Станислав
00000Доминова Ирина, Сухих
00000Станислав, Виктор Шаманский,
00000Валерия Лобанова
00000Доминова Ирина
00000Сухих Станислав
00000Виктор Шаманский, Валерия
00000Лобанова
00000Доминова Ирина, Сухих
00000Станислав
00000Доминова Ирина
00000Сухих Станислав
00000Доминова Ирина, Сухих
00000Станислав, Виктор Шаманский,
00000Валерия Лобанова
00000Доминова Ирина
00000Сухих Станислав
00000Доминова Ирина, Сухих
00000Стванисла
00000Доминова Ирина, Сухих
00000Станислав, Виктор Шаманский,
00000Валерия Лобанова
00000Доминова Ирина
00000Сухих Станислав
00000Доминова Ирина, Сухих
00000Станислав
00000Доминова Ирина, Сухих
00000Станислав, Виктор Шаманский,
00000Валерия Лобанова
00000Доминова Ирина
00000Сухих Станислав
00000Доминова Ирина, Сухих
00000Станислав
00000Доминова Ирина, Сухих
00000Станислав, Виктор Шаманский,
00000Валерия Лобанова
00000Доминова Ирина
00000Сухих Станислав
00000Доминова Ирина, Сухих
00000Станислав, Виктор Шаманский,
00000Валерия Лобанова
ПРОГРАММА ШКОЛЫ
Лекции
0
Открытие хакатона. Лекция «История
развития молекулярно-генетических
методов анализа. Разнообразие геномов
и их структура»
Биоинформатика как новая наука
Подготовка данных к анализу
Основные ферменты генетической
инженерии
Маппирование на референсы
Методы выделения нуклеиновых кислот
Поиск вариаций
Блоттинг
Анализ найденных вариантов
Секвенирование нуклеиновых кислот
Визуализация и интерпретация
Молекулярная филогенетика
Практические занятия
0
Основные статистические показатели
Вычисление описательных характеристик в R
Построение и интерпретация графиков в R
Построение графиков с помощью ggplot2
Меры различий несвязанных выборок
Сравнение несвязанных выборок в R
Однофакторный и многофакторный
дисперсионный анализ
Дисперсионный анализ в R
Меры различий связанных выборок
Сравнение связанных выборок в R
Корреляция и линейная регрессия
Корреляция и линейная регрессия в R
Логистическая регрессия
Дискриминантный анализ
